Independiente del Valle le propinó una contundente goleada 4-0 a Barcelona SC en el estadio Monumental de Guayaquil, lo que significó el adiós del invicto de Segundo Castillo a cargo del cuadro torero.
En 2024, el ‘Mortero’ comenzó a dirigir a Barcelona tras la salida de Ariel Holan quien se despidió del club tras ese 3-0 ante El Nacional en el Olímpico Atahualpa.
En ese año, estuvo a cargo del equipo en 7 partidos donde registró 3 triunfos, 4 empates y nunca vio la derrota. En esos partidos, anotó 20 goles y encajó 8.
Mientras que, en 2025, llevaba 6 partidos oficiales, sin contar la derrota ante IDV, tres en Copa Libertadores y 4 en LigaPro. Castillo registró 5 triunfos y un empate con 13 goles a favor y 4 en contra.

Partidos al mando de Segundo Alejandro Castillo
- 28 de abril – Emelec 1-1 Barcelona SC
- 20 de octubre – Barcelona SC 2-1 Emelec
- 27 de octubre – Barcelona SC 4-0 Delfín
- 2 de noviembre – Aucas 1-1 Barcelona SC
- 10 de noviembre – Barcelona SC 8-1 Cumbayá
- 16 de noviembre – Barcelona SC 6-0 El Nacional (Amistoso Copa Zapping)
- 23 de noviembre – Técnico Universitario 2-2 Barcelona SC
- 1 de diciembre – Barcelona SC 2-2 Mushuc Runa
- 14 de febrero – Manta FC 2-3 Barcelona SC
- 19 de febrero – El Nacional 0-1 Barcelona SC (Libertadores)
- 23 de febrero – Barcelona SC 1-0 Mushuc Runa
- 26 de febrero – Barcelona SC 1-1 El Nacional (Libertadores)
- 1 de marzo – Libertad 1-4 Barcelona SC
- 5 de marzo – Barcelona SC 3-0 Corinthians (Libertadores)
- 8 de marzo – Barcelona SC 0-4 Independiente del Valle
Cabe recordar que desde 2022, ha trabajado con Fabián Bustos, Jorge Célico, Diego López y Ariel Holan.
